Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Syce1lQ5D525 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syce1lQ5D525 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms