Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Xirp2Q4U4S6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms