Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3lQ4KL14 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms