Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Carmil2Q3V3V9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Carmil2Q3V3V9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms