Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms