Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Garnl3Q3V0G7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms