Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttc9Q3V038 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttc9Q3V038 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9Q3V038 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ttc9Q3V038 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ttc9Q3V038 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9Q3V038 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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