Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd3l2Q3UXB0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms