Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc114Q3UX62 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms