Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnga4Q3UW12 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms