Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BB287469Q3UT53 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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BB287469Q3UT53 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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BB287469Q3UT53 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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BB287469Q3UT53 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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BB287469Q3UT53 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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BB287469Q3UT53 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BB287469Q3UT53 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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