Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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D13Ertd608eQ3UPR8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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