Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rmi2Q3UPE3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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