Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms