Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upf3aQ3ULJ3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms