Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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