Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snx27Q3UHD6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snx27Q3UHD6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Snx27Q3UHD6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Snx27Q3UHD6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms