Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr41Q3UDP0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms