Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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