Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms