Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms