Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Hhla1Q3TYV2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Hhla1Q3TYV2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hhla1Q3TYV2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms