Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Srsf6Q3TWW8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms