Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms