Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdnep1Q3TP92 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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