Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms