Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms