Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms