Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cul4aQ3TCH7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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