Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc2Q3SXD3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms