Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Colec11Q3SXB8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms