Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hdgfl1Q2VPR5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdgfl1Q2VPR5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdgfl1Q2VPR5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdgfl1Q2VPR5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdgfl1Q2VPR5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdgfl1Q2VPR5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hdgfl1Q2VPR5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hdgfl1Q2VPR5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms