Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim71Q1PSW8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms