Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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ptchd1Q14B62 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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