Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd2Q149F1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms