Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms