Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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VgfQ0VGU4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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VgfQ0VGU4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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VgfQ0VGU4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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VgfQ0VGU4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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VgfQ0VGU4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VgfQ0VGU4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms