Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col19a1Q0VF58 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms