Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp2b3Q0VF55 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp2b3Q0VF55 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms