Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd12Q0VE29 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Samd12Q0VE29 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms