Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc1Q0VDN7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms