Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Ttc21bQ0HA38 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Ttc21bQ0HA38 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Ttc21bQ0HA38 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc21bQ0HA38 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc21bQ0HA38 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms