Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf541Q0GGX2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms