Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnnm1Q0GA42 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms