Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms