Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CbfbQ08024 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CbfbQ08024 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms