Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a2Q07643 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms