Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col17a1Q07563 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col17a1Q07563 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms