Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms