Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AmbpQ07456 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms